Chuck har turen på sin sida. Den levande datorn Intersect II är redo för spionuppdrag och det innebär att den förra Intersect (Chuck) kan återgå till sitt normala liv, men om Chuck slutar är det slut med honom: Casey har nämligen blivit beordrad att mörda honom. I den andra säsongen löser Chuck mysterier i det förflutna, blir dagens hjälte, och - i den överraskande säsongsfinalen - hackar sig rätt in i en ännu läskigare framtid.
