Art Jeffries är en avhoppad FBI-agent som kämpar mot hänsynslösa agenter för att skydda Simon, en nioårig autistisk pojke som lyckas knäcka regeringens oåtkomliga och superhemliga kod. Simon kan lösa den mest avancerade krypteringskoden Mercury lika lätt som andra barn kan läsa vanliga ord. Denna förmåga gör den nya hemliga koden sårbar, i synnerhet om USA:s fiender skulle få reda på Simons begåvning och kidnappa honom. IT-ansvarige säkerhetschefen Nick Kudrow ger order att "säkerhetshotet" skall röjas ur vägen, men Kudrow har inte räknat med Jeffries inbladning. Men livsfarliga mördare i hälarna inser Jeffries snabbt att ingen är tillförlitlig. Men tiden håller på att rinna ut och Jeffries förstår att hans enda hopp att överleva är att använda Simons speciella begåvning för att skipa rättvisa mot fienden.
